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    熱門(mén)文獻 | Nature同款:可編程的蛋白質(zhì)遞送系統中的質(zhì)粒

    熱門(mén)文獻速遞

    2023年3月底,CRISPR的先驅者,華人科學(xué)家張鋒教授及其團隊在 Nature 期刊發(fā)表了題為:Programmable protein delivery with a bacterial contractile injection system 的研究論文。

    01文章概覽

    文章中張峰團隊的研究者們從微生物中取材,制造出了全新的蛋白遞送系統。該系統形似“注射器”,可以通過(guò)改變結合基團以接近100%的效率靶向特定細胞,遞送Cas9蛋白等基因編輯組件或生物毒素,以實(shí)現基因編輯、調控特定生理過(guò)程乃至殺死癌細胞等目的。

    內共生細菌(Endosymbiotic bacteria)是一類(lèi)特殊的細菌,它們可以寄生在宿主細胞的內部,并已進(jìn)化出復雜的傳遞系統使其分泌調節宿主細胞的生物因子。例如,細胞外可收縮注射系統(eCIS),正是這樣一種類(lèi)似于“注射器”的大分子復合物。eCIS通過(guò)驅動(dòng)一個(gè)“針頭”結構穿透細胞膜,然后將攜帶的蛋白質(zhì)有效載荷注入到真核細胞中。

    通過(guò)重新編程的pvcs進(jìn)行蛋白質(zhì)遞送的模型

    在這項最新研究中,張鋒團隊首先選定了eCIS的一個(gè)亞型——Photorhabdus virulence cassette(PVC)。PVC由一個(gè)約20kb的操縱子組成,包含16個(gè)核心基因(pvc1-16),以及下游的有效載荷Pdp1和Pnf。研究團隊發(fā)現,PVC有效載荷蛋白的N端高度無(wú)序區域是其“包裝結構域”,只要將其與想要遞送的蛋白(例如GFP)融合,就能將其加載到PVC復合體中。

    PVC系統可以被重新編程以在真核細胞中定制蛋白遞送

    于是,研究團隊使用人工智能蛋白設計平臺AlphaFold,通過(guò)氨基酸序列預測蛋白質(zhì)結構,重新設計了發(fā)光桿菌的注射器,使之從靶向結合昆蟲(chóng)細胞改為靶向結合人類(lèi)細胞。類(lèi)似的,這套系統也可以學(xué)會(huì )靶向小鼠細胞。細胞實(shí)驗的結果顯示,經(jīng)過(guò)改造,“注射器”識別人類(lèi)細胞和小鼠細胞的效果接近100%。

     

    02未來(lái)應用方向

    同時(shí),研究人員通過(guò)重新設計發(fā)光桿菌eCIS的另一部分,還能根據需要讓它們裝載不同的蛋白質(zhì),包括基因編輯系統的核酸酶Cas9、堿基編輯器、可以殺死癌細胞的毒素等。

    重新設計細菌的胞外可收縮注射系統,將其改造為專(zhuān)門(mén)靶向特定人類(lèi)細胞遞送所需蛋白質(zhì)的裝置

    結果表明,PVC系統經(jīng)過(guò)改造后可以在細胞和體內靶向遞送蛋白質(zhì),并在基因編輯、癌癥治療和臨床靶向遞送等領(lǐng)域展現出廣闊的應用前景,未來(lái)可能成為許多生物療法的關(guān)鍵遞送工具。

     

    03文章中的實(shí)驗材料:質(zhì)粒

    在最后的實(shí)驗數據部分,張峰團隊也將文章中使用到的質(zhì)粒都寄存在了全球非盈利質(zhì)粒收藏中心:Addgene,以便于對該技術(shù)感興趣的其他科學(xué)家可以便捷的獲得同款質(zhì)粒。

    如果您也對這篇文章中的質(zhì)粒感興趣,可以聯(lián)系我們訂購,具體產(chǎn)品清單可以訪(fǎng)問(wèn)如下鏈接進(jìn)行選擇。

    https://www.addgene.org/browse/article/28233921/

     

    04ADDGENE與中源

    ADDGENE成立于2004年,位于美國馬薩諸塞州,是一家非營(yíng)利性的機構,最初由三位華人科學(xué)家一起建立,其目的是幫助科學(xué)家更好的分享和收藏質(zhì)粒。

    在A(yíng)DDGENE建立之前,科學(xué)家們分享質(zhì)粒是一件非常困難的事情。ADDGENE建立后,科學(xué)家發(fā)表文章中如涉及到質(zhì)粒,只需要將質(zhì)粒寄送給ADDGENE,他們就會(huì )負責后續的質(zhì)粒分發(fā)工作。其他科學(xué)家讀到這篇文獻后,可以很方便的從ADDGENE獲取需要的質(zhì)粒用于以后的研究。Addgene的使命是:通過(guò)加快對有質(zhì)粒、病毒、文庫等有用材料和信息的研究和分享,以加快科學(xué)的研究和發(fā)現。

    截止目前ADDGENE共有質(zhì)粒122,816種(來(lái)自5,499個(gè)實(shí)驗室),768種病毒(其AAV病毒742種,慢病毒26)種,向全球111個(gè)國家進(jìn)行分發(fā),未來(lái)ADDGENE還將開(kāi)始分發(fā)抗體產(chǎn)品,并提供這些抗體在實(shí)驗室中應用的一些數據結果,以供全球科學(xué)家參考。同時(shí),ADDGENE也建立了AAV病毒的數據共享中心,分享全世界科學(xué)家在A(yíng)AV方面的最近研究結果。

    過(guò)去,中國科學(xué)家購買(mǎi)ADDGENE產(chǎn)品需要和ADDGENE美國總部聯(lián)系,付匯以及海關(guān)清關(guān)等都比較麻煩,為此,ADDGENE指定北京中源合聚生物科技有限公司為其中國分銷(xiāo)商,以便為中國科學(xué)家提供更好的服務(wù)。我司于2012年8月1日開(kāi)始正式成為ADDGENE在中國大陸地區指定的唯一代理商,致力于為中國用戶(hù)提供更快更專(zhuān)業(yè)的質(zhì)粒進(jìn)口服務(wù),助力中國科研。

    參考文獻

    [1]https://www.nature.com/articles/s41586-023-05870-7

    [2]https://www.instrument.com.cn/news/20230330/658254.shtml

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