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    Bio-techne|選好對照,給實(shí)驗上道保險

    當我們歷經(jīng)種種挑戰獲得實(shí)驗結果,經(jīng)常會(huì )發(fā)出疑問(wèn)三連:

    • 我的實(shí)驗結果是不是準確?
    • 我的結果是否出現假陽(yáng)性或假陰性?
    • 結果的差異是不是因實(shí)驗設計中的變量造成的?

    要回答這些問(wèn)題,合適的對照樣品就成了不可或缺的一環(huán)。

     

    一、陰性對照與陽(yáng)性對照

    • Western Blot 實(shí)驗結果有雜帶?
    • IHC 實(shí)驗沒(méi)有陽(yáng)性信號?
    • 目的蛋白表達定位與文獻報道的有出入怎么辦?

    要回答這些問(wèn)題,就需要在實(shí)驗中設置陰性或陽(yáng)性對照。

    陽(yáng)性對照品一般會(huì )使用文獻或數據庫中報道的高表達目的蛋白的組織或細胞。陽(yáng)性對照確保了實(shí)驗的靈敏度,也保證了實(shí)驗過(guò)程中抗原抗體的結合效率。

    陰性對照品一般會(huì )使用或文獻或數據庫中報道的低表達目的蛋白的組織或細胞,使用敲低或敲除目的基因的樣本。在 IHC/ICC 實(shí)驗中,也可以用 PBS 或同型對照代替一抗。陰性對照確保了實(shí)驗的特異性,排除非特異性信號對結果造成的干擾。

     

    接下來(lái),我們舉個(gè)例子:

    比如用二乙基亞硝胺誘導小鼠肝纖維化,常常用 Alpha-SMA 作為肝纖維化的標志物。在進(jìn)行 IHC 實(shí)驗時(shí),為了保證陽(yáng)性信號的可靠性,就需要平行加一個(gè)胃或結腸組織的樣本作為對照。因為,Alpha-SMA 會(huì )特異性的表達在平滑肌細胞,而黏膜細胞無(wú)表達。

    圖片來(lái)源:W Li et al. Cell Death Dis (2019).

    如上圖的所示,胃平滑肌層陽(yáng)性信號明顯,黏膜層無(wú)陽(yáng)性信號,證明抗體得到的信號是敏感且特異的(Alpha-SMA,貨號 NBP2-33006)。

     

    二、同型對照

    這個(gè)概念,相信深諳流式細胞技術(shù)的小伙伴都耳熟能詳。因為抗體本身的特殊功能,特別是抗體 IgG Fc 段與細胞的 Fc 受體結合的能力,會(huì )使實(shí)驗結果的非特異性信號加強。

    同時(shí),在一些抗體的功能性實(shí)驗,比如中和實(shí)驗和封閉實(shí)驗中,也會(huì )對細胞(尤其是免疫細胞)的生理功能產(chǎn)生一定的影響,進(jìn)而導致實(shí)驗結果與預期或文獻報道不相符。

    抗體結構與抗體類(lèi)型示意圖

    這時(shí),同型對照就是必不可少的工具:

    同型對照是陰性對照的一種,是利用與實(shí)驗抗體同亞型的免疫球蛋白,排除實(shí)驗本底信號的工具。廣泛運用在免疫組化、免疫熒光、流式細胞術(shù)、抗體封閉中和實(shí)驗等一些以抗原-抗體結合為基礎的實(shí)驗中。

    同型對照需要選用與目標抗體相同種屬來(lái)源、相同的免疫球蛋白類(lèi)型及亞型的抗體。如果是應用在流式細胞術(shù),還需要標記相同的熒光素。我們通常建議選用來(lái)自與特異熒光抗體相同生產(chǎn)廠(chǎng)家的同型對照抗體, 因為其生產(chǎn)工藝、熒光蛋白比值以及標記工藝都是相同的。

    比如:

    用  Mouse Anti-Human MICA PE-conjugated Monoclonal Antibody(貨號 FAB1300P)檢測 K562  細胞表面的 MICA,因為該抗體的種屬來(lái)源是小鼠,免疫球蛋白是 IgG,亞型是 2B,標記的熒光素是 PE,所以,我們使用的同型對照應該是 Mouse IgG2B PE 抗體(貨號 IC0041P)。

    如上圖,左邊藍色的峰為同型對照,右邊橙色的峰為 MICA 特異性的 PE 信號峰。有了同型對照,自然就能分辨出合適的陽(yáng)性熒光強度,為之后設門(mén)和進(jìn)一步分析打下可靠的基礎。

    設置合適的對照就像給實(shí)驗加上一層保險,保證了實(shí)驗結果的可靠性,也為后續實(shí)驗的優(yōu)化及 trouble shooting 提供了重要的線(xiàn)索。

     

    以上文字和圖片來(lái)源于Bio-techne

     

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