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E. coli 你真的了解嗎?
您一直在努力設計一個(gè)理想的質(zhì)粒——需要仔細挑選目的基因的最優(yōu)啟動(dòng)子,并完美的克隆到空骨架中,確保給您的基因添加了正確的標簽,甚至用IRES元件隔開(kāi)下游添加的熒光蛋白。您為此付出了大量精力!那么讓我們先花點(diǎn)時(shí)間來(lái)認識一下幫助您復制新質(zhì)粒的小小原核生物:大腸桿菌。
E.coli 你真的了解嗎?
本文將為您介紹常見(jiàn)的大腸桿菌菌株特性,以便幫您加以區分,并確定它們是否適合于您的質(zhì)?;蜻M(jìn)行您的實(shí)驗。
History of E. coli Strains
大腸桿菌是革蘭氏陰性的棒狀細菌,Dr. Theodor Escherich在1885年首次描述大腸桿菌并為它命名。大腸桿菌常見(jiàn)于動(dòng)物腸道,天然的大腸桿菌菌株有很多種,其中一些對人類(lèi)是致命的?,F在多數實(shí)驗室使用的商用大腸桿菌是由兩個(gè)菌株分離出來(lái)的,K-12株和B株。K-12是在1920年從一名病人中分離出來(lái)的,最終成為常見(jiàn)的實(shí)驗室菌株MG 1655及其衍生物DH5 alpha和DH10b。B株的歷史較為復雜,它很可能是在1918年分離出來(lái)的,但在1942年第一次被命名為“B株”。BL 21菌株和衍生物是最常見(jiàn)的大腸桿菌B株。
Common E. coli Strains Used in the Lab
可以發(fā)現今天大多數商業(yè)菌株都是為了一些特定的目的:快速生長(cháng),高通量克隆,常規克隆,克隆不穩定的DNA,制備非甲基化DNA,等等。許多突變使這些特征成為可能,并存在于大多數商業(yè)菌株中,尤其是那些能使質(zhì)粒產(chǎn)量和/或DNA質(zhì)量提高的突變。下面的表1列出了一些比較常見(jiàn)的大腸桿菌基因突變情況。
表1-大腸桿菌菌株常見(jiàn)的基因突變
此外,表2提供了快速了解一些流行菌株的信息,包括:他們的基因型,以及他們在實(shí)驗室的主要用途。這些菌株都是基于大腸桿菌K-12,被定義為是生物安全一級菌株(BSL-1)。
表2-實(shí)驗室大腸桿菌菌株
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