咨詢(xún)熱線(xiàn)
400-810-0881
Western中的那些一知半解
Western Blotting即免疫印跡實(shí)驗,用于蛋白質(zhì)的定性分析,同時(shí)能夠粗略的估計蛋白質(zhì)的分子量大小,可謂生物實(shí)驗的必備技能,傳統的Western實(shí)驗流程包括轉膜、一抗雜交、二抗雜交、顯色。根據二抗標記的不同可分為酶標二抗和熒光二抗,常見(jiàn)的用于標記二抗的兩種酶是HRP辣根過(guò)氧化物酶和AP堿性磷酸酶,熒光二抗一般多用Cy3或者Cy5標記。
HRP標記時(shí)顯色多用ECL試劑,即底物魯米諾和過(guò)氧化氫,HRP催化魯米諾產(chǎn)生多步氧化反應,使之從基態(tài)躍升至激發(fā)態(tài)并伴隨產(chǎn)生428nm的低強度發(fā)射光,可以利用CCD或膠片進(jìn)行檢測,ECL檢測靈敏度極高,目前多個(gè)廠(chǎng)商正在挑戰fg級別。另外有小伙伴會(huì )問(wèn)DAB也可用于HRP標記的顯色,為什么應用在Western里面很少呢?盡管DAB顯色可以產(chǎn)生棕紅色的可見(jiàn)條帶非常利于觀(guān)察,但是DAB顯色靈敏度較低,對底物的量要求在500pg以上,所以多用于組化顯色。還有一種AP堿性磷酸酶標記的二抗多用BCIP/NBT試劑盒進(jìn)行顯色,BCIP在堿性磷酸酶的作用下水解,水解產(chǎn)物和NBT發(fā)生反應產(chǎn)生肉眼可見(jiàn)的不溶物,形成有顏色條帶,加水后可以終止反應(小編依然清楚的記得第一次做AP顯色看到條帶時(shí)激動(dòng)的拿著(zhù)洗瓶揮舞的自我),BCIP/NBT顯色靈敏度在100pg左右。這下知道為什么大多的客戶(hù)都選擇ECL顯色了吧,畢竟高豐度的蛋白沒(méi)那么多哦。
熒光二抗用起來(lái)就非常方便了,二抗上直接帶標記,所以直接拿去曝光顯色,一張膜可以同時(shí)雜兩個(gè)抗體,不用為內參而裁膜的感覺(jué)真好。
2019年的第一個(gè)心愿就是把2018年沒(méi)有解決的,本該在2017年就該完成的Western實(shí)驗解決掉。本期內容要幫助大家把Western這個(gè)實(shí)驗的坑填一填,那就從轉膜開(kāi)始吧!
1、轉 膜
1. PVDF膜和NC膜區別在哪?
答:通常,PVDF膜蛋白吸附能力強,而NC膜背景更干凈;PVDF膜由于疏水等原因,所以使用前需要100%甲醇浸潤;NC膜使用方便但比較脆。如果蛋白豐度較低,推薦使用PVDF膜。
2. 膜有多種孔徑,該如何選擇?
答:最常用的膜孔徑是0.45 μm,適合檢測分子量>20kDa的蛋白。0.2 μm 孔徑適合檢測10-20kDa之間的蛋白。0.1 μm 孔徑適合檢測<10kDa的蛋白。
3. PVDF膜可以反復雜交么?
答:對于PVDF膜上的大部分蛋白,在stripping后重新封閉雜交,仍然能夠進(jìn)行顯色出條帶。
4. 濕轉和半干轉如何選擇?
答:半干轉時(shí)間短速度快,試劑耗費少,但前期需要幾次的摸索,且不同的半干轉印儀器轉印條件相差較多。濕轉成功率高,但相對費時(shí),可根據實(shí)驗條件和個(gè)人喜好來(lái)選擇合適的方案。
2、封 閉
1. 選擇脫脂奶粉還是BSA?
答:通常,磷酸化蛋白的檢測使用BSA進(jìn)行封閉,普通蛋白脫脂奶粉即可,盡量選擇高品質(zhì)的脫脂奶粉,減少抗體淬滅及非特異條帶。
2. 封閉失敗案例!
答:剛參加工作的時(shí)候,接到客戶(hù)電話(huà)說(shuō)顯色沒(méi)條帶,一直都在幫客戶(hù)排查樣品和抗體的問(wèn)題,一直未解決,直到一日翻看客戶(hù)發(fā)過(guò)來(lái)的圖片,發(fā)現5%脫脂奶粉的玻璃瓶里微微發(fā)綠(其實(shí)就是長(cháng)菌了)。猜想客戶(hù)是配了一瓶奶粉放冰箱里,隨用隨???果不其然,客戶(hù)說(shuō)一直都是這樣做的啊,以前的蛋白條帶都沒(méi)問(wèn)題。小編當時(shí)差點(diǎn)一口老血噴出一丈遠,親,咱不差這點(diǎn)奶粉,長(cháng)菌了就不要再用了!
3、一 抗
1. 一抗選擇的時(shí)候注意哪些問(wèn)題?
答:通常,優(yōu)先選擇單克隆抗體,非特異性條帶少。除少量標簽抗體外,務(wù)必注意物種特異性,盡量選擇文獻中使用較多的抗體。
2. WB的一抗為何很少有直接帶HRP標記的呢?
答:首先由于一抗生產(chǎn)周期較長(cháng),成本較高,利用化學(xué)反應標記基團損失大量抗體的同時(shí)會(huì )降低抗體的親和力,其次樣品中目標條帶的量較少,所以一抗結合后信號強度較低,顯色時(shí)條帶很弱。而流式抗體直標較多,且標記的熒光基團信號如FITC,PE等,其信號強度大且易于檢測。
4、二 抗
1. 二抗選擇的時(shí)候注意哪些問(wèn)題?
答:通常,二抗選擇首要問(wèn)題是種屬特異性,一抗如果是兔抗,那么二抗可以選擇羊抗兔,鼠抗兔等。選擇親緣性較遠的種屬,能夠顯著(zhù)提高特異性。
2. 二抗的主要作用是?
答:結合一抗的同時(shí),把一抗信號級聯(lián)放大很多倍,并且二抗上帶有HRP等標記,可以進(jìn)行顯色反應。把微弱的信號放大到可供檢測的范圍內。二抗一般結合在一抗的FC區,不會(huì )競爭性的結合在一抗的V區。
5、顯 色
1. 顯色液如何使用和保存?
答:通常將AB液充分混合后,按照膜面積進(jìn)行配置,注意效期避光保存。
2. 顯色沒(méi)條帶怎么辦?
答:在確定樣品,抗體等均無(wú)問(wèn)題后,選擇靈敏度高的顯色液,fg級別的顯色液能夠針對低豐度的蛋白進(jìn)行有效顯色。
文中圖片來(lái)源:GE官網(wǎng)
中源生物是GE授權的中國北方區總代理
如有相關(guān)問(wèn)題請撥打免費服務(wù)電話(huà)咨詢(xún)
400-8100-881
如您對我們的服務(wù)有任何的意見(jiàn)和建議請發(fā)至如下郵箱
service@sinozhongyuan.com