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“吃(自)貨(噬)指南”
“吃貨指南”序
俗話(huà)說(shuō):“吃的好,才能身體倍兒棒!”。本文將為大家講一講“吃什么”?論一論“怎么吃”?還在等什么,趕緊收下這篇“吃(zi)貨(shi)”寶典吧??!
自噬類(lèi)型
自噬是將大分子和細胞器轉運至溶酶體,使其降解和回收再利用的過(guò)程。這一過(guò)程的目標是消除過(guò)量或有缺陷的細胞器以及聚集的衰老蛋白。在水解之后,基本的分子原件被回收到細胞質(zhì)中,作為細胞的組成材料或能量來(lái)源。因此,自噬在細胞內穩態(tài)機制中起著(zhù)關(guān)鍵作用,控制著(zhù)細胞的可用資源和能源消耗之間的平衡。
自噬的三種主要類(lèi)型是巨自噬,微自噬和分子伴侶介導的自噬。自噬小體僅在巨自噬過(guò)程中參與胞質(zhì)成分的降解
巨自噬:胞質(zhì)成分被隔離在雙膜細胞器或自噬小體內。自噬小體與溶酶體的融合形成了自噬溶酶體,并降解底物。本指南主要關(guān)注的是巨自噬的過(guò)程(以下簡(jiǎn)稱(chēng)自噬)。
微自噬:溶酶體通過(guò)溶酶體膜的內陷直接吞噬胞質(zhì)成分。
分子伴侶介導的自噬:伴侶蛋白(如熱休克同源蛋白70:HSC-70)與胞質(zhì)蛋白相互作用使其降解。這個(gè)復合物被溶酶體相關(guān)膜蛋白2A (LAMP - 2A)識別,使得未折疊的細胞質(zhì)蛋白轉移進(jìn)入溶酶體。
選擇性“自噬”
胞質(zhì)成分會(huì )被成批降解或選擇性自噬靶向降解,哺乳動(dòng)物的選擇性自噬依賴(lài)于兩種主要成分:選擇性自噬受體和脂化LC3(微管相關(guān)蛋白輕鏈3)蛋白。它們的相互作用使得不同細胞成分發(fā)生特異性降解,這些細胞成分包括線(xiàn)粒體、內質(zhì)網(wǎng)、聚集蛋白和核糖體等。
選擇性自噬受體的類(lèi)型:選擇性自噬通路被廣泛地歸類(lèi)為非泛素依賴(lài)或泛素依賴(lài)兩種類(lèi)型,并涉及到銜接蛋白或選擇性自噬受體,直接或通過(guò)泛素與細胞靶點(diǎn)相互作用。
泛素依賴(lài)性自噬:選擇性自噬受體通過(guò)泛素結合域(UBD)與泛素化的分子相互作用。這種選擇性自噬通路與泛素-蛋白酶體系統相互作用,以消除蛋白聚集物。許多其他細胞成分通過(guò)這些受體被靶向降解。影響與分子相互作用的受體特異性的因素尚未完全闡明。值得注意的是受體的選擇性有很大部分的重疊。
非泛素依賴(lài)性自噬:受體直接將各種分子和細胞器作為靶標,包括蛋白質(zhì)、脂類(lèi)、過(guò)氧化物酶體和溶酶體,以及許多其他細胞成分。
選擇性自噬受體包含一個(gè)LC3交互區域(LIR motif),用于與LC3家族成員結合。它們通過(guò)具有泛素依賴(lài)性或非依賴(lài)性的第二個(gè)結合基序與細胞分子相互作用
自噬可能通過(guò)多種或某一選擇性機制發(fā)生。選擇性自噬通路的命名是基于靶向降解的分子類(lèi)型
LC3異構體
在哺乳動(dòng)物中,已經(jīng)發(fā)現了多個(gè)LC3家族成員,它們屬于兩個(gè)主要亞家族,LC3和GABARAP。不同的異構體在選擇性自噬中可發(fā)揮特殊的作用。
LC3和GABARAP家族成員
自噬機制和自噬流
在酵母中,自噬過(guò)程共有31種自噬相關(guān)蛋白(ATG)的參與調節,許多自噬相關(guān)蛋白在哺乳動(dòng)物中都是保守的。每個(gè)自噬相關(guān)蛋白都在自噬的動(dòng)態(tài)過(guò)程中發(fā)揮著(zhù)特定的作用。
自噬過(guò)程包括誘導,囊泡核化,囊泡伸長(cháng),融合和降解等一系列過(guò)程。自噬相關(guān)蛋白在每一步都催化特定反應,對自噬流的產(chǎn)生至關(guān)重要
誘導: 在自噬研究中,饑餓或營(yíng)養缺乏是應用最多的誘導方法。對饑餓誘導的自噬通常依賴(lài)于mTOR激酶(哺乳動(dòng)物雷帕霉素靶蛋白)的抑制,這是營(yíng)養信號的關(guān)鍵調控器。在mTOR抑制中,包括ULK1(unc-51樣激酶-1)、ATG13和RB1CC1(RB1-卷曲螺旋-1)在內的蛋白質(zhì)復合物的磷酸化同時(shí)減少,增加了ULK1的活性并誘導自噬。
成核和吞噬泡形成: 新生的吞噬泡膜起源于高爾基體、內質(zhì)網(wǎng)、線(xiàn)粒體或核內體。原始吞噬細胞器或吞噬泡的形成依賴(lài)于從抑制因子bcl-2中釋放的Beclin1和AMBRA1(激活存在于BECN1調控的自噬蛋白1中的分子)。從抑制中釋放得以形成的Ptdlns3K復合物(III類(lèi)磷脂酰肌醇-3激酶),包括ATG14、VPS15和VPS34(空泡分選蛋白)。這種復合物產(chǎn)生磷脂酰肌苷-3-磷酸,并促進(jìn)ATG蛋白的招募進(jìn)入新生膜。
延伸,自噬小體形成: 兩種泛素樣共軛復合體的激活促進(jìn)囊泡延伸。在第一個(gè)復合物中,ATG7和ATG10參與了ATG12與ATG5的共價(jià)結合。ATG12 / ATG5的共價(jià)結合復合物與ATG16 (ATG16樣-1)的相互作用可以促進(jìn)第二個(gè)泛素樣共軛復合體的形成。在第二種復合物中,ATG4、ATG7和ATG3參與到可溶性L(fǎng)C3轉化為脂質(zhì)共軛體LC3-II的過(guò)程。LC3是與吞噬泡膜相關(guān)的磷脂酰乙醇胺基脂類(lèi)。概括起來(lái)說(shuō),這兩個(gè)泛素樣的共軛復合體參與了自噬小體的形成。在延伸期結束時(shí),吞噬泡膜已經(jīng)擴張并閉合,完成了胞內成分的隔離。所有的自噬相關(guān)蛋白脫離自噬小體并返回細胞質(zhì)。只有脂化的 LC3是唯一的被認為與自噬小體膜有關(guān)的自噬相關(guān)蛋白。
融合和降解: 饑餓時(shí),SNARE蛋白STX17(突觸融合蛋白-17)位于自噬小體上。STX17與SNAP29和溶酶體的VAMP8相互作用使自噬小體與溶酶體融合,形成成熟的水解細胞器。融合之后,質(zhì)子泵和水解酶被釋放進(jìn)入自噬小中,形成自噬溶酶體,使細胞內容物酸化和水解。
以上文字、圖片來(lái)源于:Bio-techne
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